哈哈哈!我来捡漏啦!

测序仪简单的来说!
测序五大宝!万变不离其宗!
测序仪说简单了,就是一个光学显微镜!

Camera+样品载玻片+试剂舱+流体系统+工作站

题主想科普,所以撇开专业术语,用最简单的语言表达!不装逼!

显微镜用过吧!

样品载玻片:将样品DNA通过化学PCR 扩增(为什么扩增,因为二代测序仪就是因为高通量高数据量而生的,通过大量数据来分析,而不进行扩增怎么知道渺小的DNA 差异呢?),然后样品牢固的固定在芯片上,通过加入化学荧光试剂结合到DNA的不同碱基(ATCG)上。

Camera:是的,二代测序一般都用光学成像系统,因为快啊,因为省钱啊。哈哈,因为之前的样品加入了化学荧光试剂,那么在我给出特定波长的光照射到样品上,那么光就会给Camera捕获到。不同的碱基(ATCG)所带的荧光是不同的,而且激活碱基的光的波长也不同的。所以,照相机就可以捕获到特定碱基的信号而且不会影响到其他碱基的信号。你问怎么做到的。行内的测序工程师都清楚,不能说太多,可以出门右转百度。

试剂舱:因为DNA是有长度大小哒,既然叫测序,那么肯定有个序列才叫测序,测序的过程需要连贯的进行化学反应,然后光学成像,然后数据处理,然后化学反应,光学成像,数据处理。是不断一个又一个的循环。因此,在测序仪反应的过程中,需要不断的添加化学反应的试剂。试剂会根据不同的测序仪设计,专门添加一个流体系统,其实说简单了,就是一个泵加几条塑料管。哈哈,看起来简单,背后涵盖了工程师多年积累的心血,如何防止产生气泡,如何控制泵液体积,如何防止漏液,如何防止样品互相污染,如果高效稳定的切换各个流路?应该使用真空驱动还是空压驱动?小小的部件,背后大大的智慧。

流体系统:为什么二代测序仪需要用到流体系统呢,不用气体或者固体?其实是和这个测序仪的原理相关的,流体的优势不得不说,易控制,能定量,稳定,等各种因素。流体系统是二代测序仪必不可少的。负责试剂泵入芯片内部进行化学反应,然后排出废液。既然用到液体,流体系统必不可少。

工作站:二代测序一个仪器运行下来可以达到200-300G甚至更多,国内某龙头老大的测序仪更不用说了。如果说Illu是一叶扁舟,那么他就是航母级别的测序仪了。既然数据产出如此巨大,必须有工作站对产出数据进行处理压缩等操作,必不可少。

当然以上说的都是主要部件,不同测序仪的设计思路和风格各异。还是那句话万变不离其宗,其实并不难。每一个人性化的界面以及大数据稳定的产出一定是背后默默付出的工程师和开发者的心血。现测序仪迭代太迅速了!目的都是看中未来基因产业的一片蓝海!即互联网时代下一个改变人的生活的,可能就是他。

利益相关:是

我就不说我公司名,吹咩,吹牛逼又不涨工资。哼!

想要成为生物届的谷歌,员工福利任重而道远啊。

来源:知乎 www.zhihu.com

作者:匿名用户

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